俄羅斯科學(xué)家參與創(chuàng)建基因組數(shù)據(jù)統(tǒng)一平臺(tái)

來(lái)自俄羅斯、美國(guó)、土耳其和歐洲的科學(xué)家開(kāi)發(fā)了一個(gè)Shambhala平臺(tái)，可將大量基因活性水平的大數(shù)據(jù)結(jié)合起來(lái)。該數(shù)據(jù)庫(kù)的創(chuàng)建將使科學(xué)家能夠?qū)⒉煌瑢?shí)驗(yàn)中兼容性較差的數(shù)據(jù)結(jié)合起來(lái)。此項(xiàng)成果發(fā)表于《分子生物科學(xué)前沿》。

該Shambhala平臺(tái)可將每個(gè)基因表達(dá)譜轉(zhuǎn)換為預(yù)定義的通用格式。這樣一來(lái)，所有數(shù)據(jù)都被合并到一個(gè)矩陣中，其中某些部分就可以進(jìn)行相互比較。該平臺(tái)既可以協(xié)調(diào)異構(gòu)數(shù)據(jù)，又考慮到了與正在研究中的基因相關(guān)的所有關(guān)鍵生物學(xué)特征。

科研人員在六個(gè)數(shù)據(jù)集上測(cè)試了該平臺(tái)的性能，其中包含約6800個(gè)腫瘤樣本和11100個(gè)人體健康組織的基因活性水平信息。測(cè)試結(jié)果顯示，Shambhala在許多參數(shù)上都優(yōu)于其他方法。

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